MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori UM299

Total Repeats: 33409

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021216	T	7	7	61	67	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021216	A	6	6	141	146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021216	AAT	2	6	167	172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021216	T	7	7	176	182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021216	TGGC	2	8	259	266	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021216	ATT	2	6	306	311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021216	TGA	2	6	314	319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021216	A	7	7	459	465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021216	T	6	6	468	473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021216	GTTC	2	8	476	483	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021216	ATTG	2	8	510	517	25 %	50 %	25 %	0 %	529858347
12	NC_021216	T	6	6	518	523	0 %	100 %	0 %	0 %	529858347
13	NC_021216	CAA	2	6	709	714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529858347
14	NC_021216	T	6	6	733	738	0 %	100 %	0 %	0 %	529858347
15	NC_021216	ATGA	2	8	749	756	50 %	25 %	25 %	0 %	529858347
16	NC_021216	T	6	6	798	803	0 %	100 %	0 %	0 %	529858347
17	NC_021216	TTC	2	6	809	814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529858347
18	NC_021216	T	7	7	863	869	0 %	100 %	0 %	0 %	529858347
19	NC_021216	AG	3	6	938	943	50 %	0 %	50 %	0 %	529858347
20	NC_021216	ATG	2	6	971	976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	529858347
21	NC_021216	GATC	2	8	1000	1007	25 %	25 %	25 %	25 %	529858347
22	NC_021216	TTGT	2	8	1097	1104	0 %	75 %	25 %	0 %	529858347
23	NC_021216	A	6	6	1149	1154	100 %	0 %	0 %	0 %	529858347
24	NC_021216	TTG	2	6	1175	1180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529858347
25	NC_021216	CAAA	2	8	1187	1194	75 %	0 %	0 %	25 %	529858347
26	NC_021216	GTG	2	6	1308	1313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529858347
27	NC_021216	AAT	2	6	1315	1320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529858347
28	NC_021216	TTC	2	6	1391	1396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529858347
29	NC_021216	GTG	2	6	1410	1415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529858347
30	NC_021216	AAAG	2	8	1420	1427	75 %	0 %	25 %	0 %	529858347
31	NC_021216	ATA	2	6	1472	1477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529858347
32	NC_021216	AAC	2	6	1511	1516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021216	TTTC	2	8	1525	1532	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021216	G	6	6	1540	1545	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021216	ATT	2	6	1565	1570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021216	GTG	2	6	1618	1623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021216	ATA	3	9	1627	1635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021216	CGCA	2	8	1659	1666	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021216	CATT	2	8	1688	1695	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_021216	GT	3	6	1811	1816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021216	TAA	2	6	1820	1825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021216	TTC	2	6	1826	1831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_021216	ATC	2	6	1845	1850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021216	TAC	2	6	1851	1856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_021216	TAG	2	6	1857	1862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021216	T	7	7	1905	1911	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021216	TAA	3	9	1939	1947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021216	ATA	2	6	1958	1963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021216	AAT	2	6	1995	2000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021216	A	7	7	2041	2047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021216	GTTT	2	8	2052	2059	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021216	TAA	2	6	2081	2086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021216	A	6	6	2128	2133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021216	AAGT	2	8	2152	2159	50 %	25 %	25 %	0 %	529858348
55	NC_021216	TAT	2	6	2161	2166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529858348
56	NC_021216	T	6	6	2193	2198	0 %	100 %	0 %	0 %	529858348
57	NC_021216	TCT	3	9	2233	2241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529858348
58	NC_021216	CAA	2	6	2280	2285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529858348
59	NC_021216	TAT	2	6	2356	2361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529858348
60	NC_021216	TAA	2	6	2391	2396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529858348
61	NC_021216	T	6	6	2487	2492	0 %	100 %	0 %	0 %	529858348
62	NC_021216	CAA	2	6	2529	2534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529858348
63	NC_021216	TGG	2	6	2549	2554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529858348
64	NC_021216	GTTT	2	8	2708	2715	0 %	75 %	25 %	0 %	529858348
65	NC_021216	T	6	6	2731	2736	0 %	100 %	0 %	0 %	529858348
66	NC_021216	GA	4	8	2767	2774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021216	TTA	2	6	2861	2866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021216	AGTA	2	8	3004	3011	50 %	25 %	25 %	0 %	529858349
69	NC_021216	GTT	2	6	3023	3028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529858349
70	NC_021216	A	8	8	3091	3098	100 %	0 %	0 %	0 %	529858349
71	NC_021216	T	7	7	3181	3187	0 %	100 %	0 %	0 %	529858349
72	NC_021216	AC	3	6	3201	3206	50 %	0 %	0 %	50 %	529858349
73	NC_021216	TCT	2	6	3411	3416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529858350
74	NC_021216	TTG	2	6	3431	3436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529858350
75	NC_021216	AAAC	2	8	3476	3483	75 %	0 %	0 %	25 %	529858350
76	NC_021216	CA	3	6	3495	3500	50 %	0 %	0 %	50 %	529858350
77	NC_021216	AAAT	2	8	3554	3561	75 %	25 %	0 %	0 %	529858351
78	NC_021216	A	6	6	3635	3640	100 %	0 %	0 %	0 %	529858351
79	NC_021216	T	6	6	3669	3674	0 %	100 %	0 %	0 %	529858351
80	NC_021216	A	6	6	3680	3685	100 %	0 %	0 %	0 %	529858351
81	NC_021216	TCT	2	6	3743	3748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529858351
82	NC_021216	A	6	6	3806	3811	100 %	0 %	0 %	0 %	529858351
83	NC_021216	GAAT	2	8	3840	3847	50 %	25 %	25 %	0 %	529858351
84	NC_021216	CCCGC	2	10	3890	3899	0 %	0 %	20 %	80 %	529858351
85	NC_021216	AAC	2	6	3912	3917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	529858351
86	NC_021216	CGC	2	6	3993	3998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	529858351
87	NC_021216	GC	3	6	4033	4038	0 %	0 %	50 %	50 %	529858351
88	NC_021216	CTT	2	6	4101	4106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	529858352
89	NC_021216	T	6	6	4136	4141	0 %	100 %	0 %	0 %	529858352
90	NC_021216	AT	3	6	4247	4252	50 %	50 %	0 %	0 %	529858352
91	NC_021216	CT	3	6	4407	4412	0 %	50 %	0 %	50 %	529858352
92	NC_021216	A	6	6	4465	4470	100 %	0 %	0 %	0 %	529858352
93	NC_021216	AAT	2	6	4489	4494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529858352
94	NC_021216	TAA	2	6	4744	4749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	529858352
95	NC_021216	A	6	6	4758	4763	100 %	0 %	0 %	0 %	529858352
96	NC_021216	TAT	2	6	4811	4816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	529858352
97	NC_021216	A	6	6	4821	4826	100 %	0 %	0 %	0 %	529858352
98	NC_021216	GTT	2	6	4846	4851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	529858352
99	NC_021216	AGCCT	2	10	4885	4894	20 %	20 %	20 %	40 %	529858352
100	NC_021216	A	6	6	4939	4944	100 %	0 %	0 %	0 %	529858352
101	NC_021216	GTG	2	6	4963	4968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	529858352
102	NC_021216	T	6	6	4976	4981	0 %	100 %	0 %	0 %	529858352
103	NC_021216	ATCATA	2	12	5061	5072	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	529858352
104	NC_021216	CAC	2	6	5250	5255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499082916
105	NC_021216	GCT	2	6	5275	5280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499082916
106	NC_021216	A	6	6	5356	5361	100 %	0 %	0 %	0 %	499082916
107	NC_021216	ACGCC	2	10	5384	5393	20 %	0 %	20 %	60 %	499082916
108	NC_021216	ATG	2	6	5488	5493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499082916
109	NC_021216	ATA	2	6	5508	5513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499082916
110	NC_021216	CGC	2	6	5520	5525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499082916
111	NC_021216	A	6	6	5550	5555	100 %	0 %	0 %	0 %	499082916
112	NC_021216	T	8	8	5574	5581	0 %	100 %	0 %	0 %	499082916
113	NC_021216	A	6	6	5624	5629	100 %	0 %	0 %	0 %	499082916
114	NC_021216	CAC	2	6	5770	5775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499082916
115	NC_021216	GTT	2	6	5887	5892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	499082915
116	NC_021216	AGG	2	6	5917	5922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	499082915
117	NC_021216	TTTA	2	8	5941	5948	25 %	75 %	0 %	0 %	499082915
118	NC_021216	CTT	2	6	5952	5957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499082915
119	NC_021216	CTT	2	6	5967	5972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499082915
120	NC_021216	TCT	2	6	6074	6079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499082915
121	NC_021216	TTC	2	6	6082	6087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499082915
122	NC_021216	T	6	6	6151	6156	0 %	100 %	0 %	0 %	499082915
123	NC_021216	TTC	2	6	6160	6165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499082915
124	NC_021216	T	7	7	6210	6216	0 %	100 %	0 %	0 %	499082915
125	NC_021216	CAC	2	6	6235	6240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	499082915
126	NC_021216	A	7	7	6275	6281	100 %	0 %	0 %	0 %	499082915
127	NC_021216	CAAC	2	8	6291	6298	50 %	0 %	0 %	50 %	499082915
128	NC_021216	A	6	6	6313	6318	100 %	0 %	0 %	0 %	499082915
129	NC_021216	ATA	2	6	6332	6337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499082915
130	NC_021216	TTTC	2	8	6384	6391	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_021216	A	6	6	6507	6512	100 %	0 %	0 %	0 %	499082914
132	NC_021216	TCT	2	6	6543	6548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499082914
133	NC_021216	TGC	2	6	6557	6562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499082914
134	NC_021216	GTC	2	6	6583	6588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	499082914
135	NC_021216	CAA	2	6	6602	6607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	499082914
136	NC_021216	TCA	2	6	6630	6635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499082914
137	NC_021216	ATTC	2	8	6643	6650	25 %	50 %	0 %	25 %	499082914
138	NC_021216	TCA	2	6	6786	6791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499082914
139	NC_021216	TCT	2	6	6798	6803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499082914
140	NC_021216	TGG	2	6	6823	6828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499082914
141	NC_021216	T	6	6	6833	6838	0 %	100 %	0 %	0 %	499082914
142	NC_021216	GAT	2	6	6839	6844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499082914
143	NC_021216	AG	3	6	6914	6919	50 %	0 %	50 %	0 %	499082914
144	NC_021216	TGG	2	6	6931	6936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	499082914
145	NC_021216	GCC	2	6	6984	6989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	499082914
146	NC_021216	ATA	2	6	7005	7010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	499082914
147	NC_021216	TCA	2	6	7077	7082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499082914
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153	NC_021216	T	6	6	7309	7314	0 %	100 %	0 %	0 %	499082914
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165	NC_021216	T	6	6	7927	7932	0 %	100 %	0 %	0 %	499082913
166	NC_021216	TGA	2	6	7963	7968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	499082913
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169	NC_021216	CAT	2	6	8128	8133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	499082913
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172	NC_021216	T	8	8	8163	8170	0 %	100 %	0 %	0 %	499082913
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178	NC_021216	AACA	2	8	8345	8352	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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274	NC_021216	A	7	7	12237	12243	100 %	0 %	0 %	0 %	499082907
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276	NC_021216	A	7	7	12300	12306	100 %	0 %	0 %	0 %	499082907
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278	NC_021216	AGA	2	6	12451	12456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	499082907
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283	NC_021216	ATT	2	6	12593	12598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	499082907
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436	NC_021216	TTGA	2	8	19055	19062	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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443	NC_021216	TCT	2	6	19223	19228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	499082899
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484	NC_021216	GGT	2	6	21298	21303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_021216	A	6	6	21572	21577	100 %	0 %	0 %	0 %	499082898
492	NC_021216	T	6	6	21582	21587	0 %	100 %	0 %	0 %	499082898
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